Что такое гаплотип и гаплогруппа

Разница между Гаплогруппой и Гаплотипом

Ключевое различие между Гаплогруппой и Гаплотипом состоит в том, что Гаплогруппа относится к группе сходных гаплотипов, которые имеют общего предка, в то время как Гаплотип относится к набору аллелей, наследуемых все вместе из поколения в поколение благодаря генетической связи.

Ген в основном состоит из двух аллелей. В хромосомах присутствуют тысячи генов. При сегрегации они показывают пересечение и генетические рекомбинации. Однако некоторые аллели генов расположены очень близко друг к другу. Проще говоря, эти аллели показывают генетическую связь. Следовательно, они вряд ли пересекутся или рекомбинируют. Вместо этого они всегда имеют тенденцию передавать все вместе из поколения в поколение. Соответственно, Гаплотип представляет собой комбинацию аллелей или набор однонуклеотидных полиморфизмов, присутствующих в одной и той же хромосоме, которые передаются из поколения в поколение от одного родителя. Гаплогруппа — это группа похожих Гаплотипов, которые имеют общего предка.

Содержание

Что такое Гаплогруппа?

Гаплогруппа — это группа похожих Гаплотипов, которые имеют общего предка. Другими словами, гаплогруппа представляет собой комбинацию аллелей, присутствующих в разных хромосомах, которые наследуются вместе. Эти аллели присутствуют очень близко друг к другу. Гаплотипы в Гаплогруппе имеют сходные паттерны и являются родственными потомками, поскольку имеют общего предка. Таким образом, Гаплогруппу легко предсказать по Гаплотипам.

У человека есть две наиболее распространенные гаплогруппы. Это гаплогруппы Y-хромосомы, которые передаются от отца к сыну, а гаплогруппы митохондриальной ДНК — от матери к дочери или сыну.

Что такое Гаплотип?

Гаплотип — это набор аллелей, унаследованных все вместе. Эти аллели присутствуют в одной и той же хромосоме очень близко друг к другу из-за генетической связи. Следовательно, нет вероятности рекомбинации или пересечения. Следовательно, они передаются из поколения в поколение. Эти аллели могут быть аллелями одного гена или аллелями нескольких генов. Гаплотип также может относиться к кластеру однонуклеотидных полиморфизмов, присутствующих в одной и той же хромосоме. Таким образом, они представляют собой набор вариаций ДНК или полиморфизмов, унаследованных все вместе.

Информация о гаплотипах используется при изучении влияния генов на болезни. Анализируя гаплотипы и деревья гаплотипов, генетики могут выявлять области генома, связанные с болезнью, и определять закономерности генетических вариаций, связанных с заболеваниями. Более того, они используются при картировании генов при размещении генетических маркеров в нужных местах на хромосомах.

Каковы сходства между Гаплогруппой и Гаплотипом?

В чем разница между Гаплогруппой и Гаплотипом?

Гаплогруппа представляет собой комбинацию аллелей, присутствующих в разных хромосомах, которые наследуются все вместе. Она состоит из похожих Гаплотипов, имеющих общего предка. Гаплотип, с другой стороны, представляет собой набор аллелей, обнаруженных в одной и той же хромосоме, которые наследуются все вместе на протяжении поколений.

Заключение — Гаплогруппа против Гаплотипа

Гаплогруппа — это группа похожих Гаплотипов, которые имеют общего предка. Гаплотип, с другой стороны, представляет собой комбинацию аллелей или набор однонуклеотидных полиморфизмов, присутствующих в одной и той же хромосоме, которые передаются из поколения в поколение от одного родителя. Следовательно, в этом ключевое отличие Гаплогруппы от Гаплотипа. Гаплотипы предоставляют простой способ прогнозирования Гаплогрупп, поскольку Гаплогруппа состоит из похожих Гаплотипов.

Источник

Гаплогруппы: описание древних родов и известные представители гаплогрупп

(в популяционной генетике человека, науке, изучающей генетическую историю человечества) — большая группа схожих гаплотипов, которые являются рядом аллелей на нерекомбинируемых участках Y-хромосомы. Галпогруппы делятся на Y-хромосомные (Y-ДНК) и митохондриальные (мт-ДНК). Y-ДНК является прямой отцовской линией, т.е сын, отец, дед и т.д., а мт-ДНК прямой материнской линией, то есть дочь, мать, бабушка, прабабушка и так далее. Термин «гаплогруппа» широко применяется в генетической ДНК генеалогии.

Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа

Гаплогруппа R1a1 насчитывает около 300 миллионов мужчин. Первый общий предок современных носителей R1a1 жил около 300 поколений назад.

Раскопки «Страны городов» на Южном Урале подтвердили, что уже примерно 4000 лет назад в укрепленном поселении Аркаим имелись помещения личного и общественного пользования, жилые и мастерские. В некоторых помещениях обнаружены не только гончарные мастерские, но и металлургическое производство.

В ходе раскопок было вскрыто около 8000 кв. м площади поселения (примерно половина), вторая часть была исследована с помощью археомагнитных методов. Тем самым была полностью установлена планировка памятника. Здесь же был впервые в Зауралье применён метод реконструкции, и Л.Л. Гуревичем сделаны рисунки возможного вида поселения. R1a1-Z93 вероятно была одной из основных гаплогрупп в Аркаиме и Синташте.

Во втором тысячелетии до нашей эры предположительно из-за климатических изменений или вследствие военных раздоров часть R1a1 (субклад Z93 и др. гаплогруппы Средней Азии) начали мигрировать на юг и восток за пределы степи, часть (субклад L657) пошла в сторону Индии и, влившись в местные племена, приняла участие в создании кастового общества. Те далекие события описаны в древнейшем литературном источнике человечества –»Ригведе».

Другая часть стала продвигаться в ближневосточном направлении. На территории современной Турции предположительно они основали Хеттское государство, успешно конкурировавшее и с древним Египтом. Хетты строили города, но не смогли прославиться сооружением огромных пирамид, так как в отличие от Египта Хеттское общество было обществом свободных людей, и им были чужды идеи использования подневольного труда. Хеттское государство исчезло внезапно, его смела мощная волна варварских племен известных как «народы моря». В середине прошлого века археологи нашли богатейшую библиотеку глиняных табличек с хеттскими текстами, язык оказался относящимся к индо-европейской группе языков. Так мы обрели детальные знания о первом государстве, часть мужских линий которого предположительно состояла из гаплогруппы R1a1-Z93.
Славянские субклады гаплогруппы R1a1-Z283 образуют свой кластер гаплотипов, который совершенно не родственен ни западно-европейским субкладам гаплогруппы R1a, ни индо-иранским и разделение европейских носителей R1a1-Z283 с азиатскими R1a1-Z93 произошло примерно 6 000 лет назад.

Большинство народов состоит из множества гаплогрупп, и не имеется рода, который бы доминировал над остальными. Связь между гаплогруппой и внешностью человека также отсутствует и как видно многие представители гаплогруппы R1a1 относятся даже к разным расам. Многим R1a1-Z93 характерны монголоидные черты (киргизы, алтайцы, хотоны и т.д.), в то время как носители R1a1-Z283 имеют в большинстве европейский вид (поляки, русские, белорусы и т.д.). Большое количество финских племен имеют высокие проценты гаплогруппы R1a1, часть из которых были ассимилированы с приходом славянских колонистов 9 века.

Достижения, к которым возможно имеют отношение R1a1:

В небольшой статье трудно рассказать всю историю первых индо-европейцев, можно лишь некоторыми историческими фрагментами пробудить интерес к истории древних предков славян. Наберите в поисковике слова индо-арии, тюрки, славяне, скифы, сарматы, Персия, и Вы окунетесь в увлекательное путешествие по славной истории индо-европейских и славянских народов.

До 2007 года никто не осуществляли детальных реконструкций родов, никому в голову не пришла эта идея, да и решить такую грандиозную задачу не было возможности. Многие популяционные генетики работали с небольшими выборками коротких 6-маркерных гаплотипов, позволяющих получать общие генографические представления о распределении гаплогрупп.

В 2009 году профессиональный популяционный генетик задался целью построить детальное генеалогическое древо этой гаплогруппы. Столкнувшись с рядом проблем, например, расчет обычными методами крупных выборок сверх длинных гаплотипов был невозможен из-за астрономического количества операций, ни один компьютер был не в состоянии перебрать нужное количество комбинаций, но благодаря находчивости и желанию построить древо своей гаплогруппы проблемы эти удалось преодолеть.
После R1a1 многие гаплогруппы приступили к созданию своих древ.

Сами гаплогруппы не несут генетической информации, т.к. генетическая информация находиться в аутосомах- первых 22 пар хромосом. Посмотреть распространение генетических компонент в Европе можно здесь. Гаплогруппы являются всего лишь метками давно минувших дней, на заре формирования современных народов.

Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа

После того, как египетские ученые провели анализ мумии Тутанхамона, было обнаружено, что фараон оказался представителем гаплогруппы R1b.

Современная концентрация гаплогруппы R1b максимальна на территориях миграционных путей кельтов и германцев: в южной Англии около 70%, в северной и западной Англии, Испании, Франции, Уэльсе, Шотландии, Ирландии — до 90 % и более. А так же, например, у басков — 88,1 %, испанцев — 70 %, итальянцев — 40 %, бельгийцев — 63 %, немцев — 39 %, норвежцев — 25,9 % и других.

В Восточной Европе гаплогруппа R1b встречается намного реже. У чехов и словаков — 35,6 %, латышей — 10 %, венгров — 12,1 %, эстонцев — 6 %, поляков — 10,2 %-16,4 %, литовцев — 5 %, белорусов — 4,2 %, русских — от 1,3 % до 14,1 %, украинцев — от 2 % до 11,1 %.

На Балканах — у греков — от 13,5 % до 22,8 %, словенцев — 21 %, албанцев — 17,6 %, болгар — 17 %, хорватов — 15,7 %, румын — 13 %, сербов — 10,6 %, герцеговинцев — 3,6 %, боснийцев — 1,4 %.

На Южном Урале значительно распространена у башкир — около 43 %.

На Кавказе обнаружена у осетин Дигора — 23 % и армян — 28,4 %.

В Турции достигает 16,3 %, Ираке — 11,3 % и в других странах Западной Азии.

В Центральной Азии обнаружена, в частности, у туркменов — 36,7 %, узбеков — 9,8 %, татар — 8,7 %, казахов — 5,6 %, уйгуров — от 8,2 % до 19,4 %

В Пакистане — 6,8 %, в Индии незначительна — 0,55 %.

У алжирских арабов из Орана — 10,8 %, тунисских арабов — 7 %, алжирских берберов — 5,8 %, в Марокко — около 2,5 %, в субсахарской Африке распространена в Камеруне — около 95 % (субклад R1b-V88).

Источник

Что такое гаплогруппы и гаплотипы?

Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа

Благодаря ДНК-тесту сегодня вы можете узнать информацию о ваших предках и путях их миграции сквозь эпохи. Конечно, нам недоступна информациях об их именах и других деталях, но благодаря тесту можно узнать немало другой интересной информации, а именно: к каким глубоким родовым группам вы принадлежите, места жительства ваших предков и их пути миграции из Африки. Эти глубокие родовые группы носят названием гаплогрупп и гаплотипов. Попробуем разобраться, что такое гаплогруппа и какую информацию она в себе несет.

Как происходило образование гаплогрупп

Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа

Изначально существовала только одна гаплогруппа в Африке. По мере того, как африканские племена уходили с континента и отправлялись в разные другие места на планете, их ДНК мутировала, а число гаплогрупп увеличивалось.

Новые гаплогруппы формируются даже сегодня, когда происходит генная мутация (смена нуклеотида) у кого-то из определенного клана. Тем не менее, чтобы мутация считалась гаплогруппой, она должна переходить из поколения в поколение и быть достаточно распространенной.

Гаплогруппы, которые формируются сегодня, в конечном итоге позволяют проследить род до первого человека, получившего мутацию. И точно так же современные известные науке гаплогруппы могут проследить родословную вплоть до самого раннего человека из прошлого (хотя мы не знаем имена этих людей, мы знаем, что они существовали и знаем, где приблизительно и когда они жили).

Гаплогруппы формировались и вымирали, и сегодня продолжают формироваться вновь. Гаплогруппы, существующие сейчас, произошли от людей, чьи потомки очень успешно заводили большие семьи.

Структура гаплогрупп

Гаплогруппы сегодня делятся на четыре основных: европейские, африканские, индейские и азиатские. Внутри этих гаплогрупп много подгрупп гаплогрупп, которые дополнительно определяют, где и когда возникли самые ранние известные неафриканские предки человека по мужской и женской линиям семьи. Большинство подгрупп гаплогрупп многочисленны. Единственная группа с менее чем тремя подгруппами – это группа людей из числа коренных американцев, которая имеет только две подгруппы.

По сути, гаплогруппы составляют карту кланов, из которых произошла современная человеческая раса. Гаплогруппы именуются в алфавитном порядке в порядке обнаружения. Так что не думайте, что ваша гаплогруппа А означает, что вы африканец, или что вы европеец с буквой Е. Подгруппы гаплогрупп названы по буквенно-цифровым комбинациям, указывающим, где и когда они были обнаружены, из какой основной гаплогруппы они происходят. Иногда они даже обозначают очень специфические небольшие географические районы, где жили самые ранние предки этой линии.

Какая разница между гаплогруппами и гаплотипами? Гаплотип – более узкое понятие. Это группа генов в организме, которые наследуются вместе от одного родителя, а гаплогруппа – это группа похожих гаплотипов, которые имеют общего предка с мутацией однонуклеотидного полиморфизма. Если говорить точнее, то гаплогруппа представляет собой комбинацию аллелей в разных областях хромосом, которые тесно связаны и имеют тенденцию наследоваться вместе. Гаплогруппы относятся к одной линии происхождения, которая появилась, как правило, тысячи лет назад.

Как определить, к какой гаплогруппе себя отнести?

Так как же узнать, какая ваша личная гаплогруппа? Для этого нужно пройти тест ДНК. Но не каждый тест даст правильный ответ. Большинство ДНК-тестов на рынке сегодня тестируют аутосомную ДНК, которая является смесью генетических маркеров, полученных от ваших предков. Это может быть полезно для поиска живых родственников и определения этнической принадлежности, но это ничего не говорит о вашем давнем прошлом.Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа

Для определения древней родословной вам нужен тест мтДНК или тест YDNA (или оба). Ваша материнская гаплогруппа основана на вашей митохондриальной ДНК, а ваша отцовская гаплогруппа основана на вашей YDNA.

Поскольку женщина не несет YDNA, то для определения ее гаплогруппы по отцовской линии, тестирование должен пройти ее родственник мужского пола – брат, отец или дядя по отцовской линии.

Как понять результаты теста? Ученые используют буквы и цифры для идентификации различных гаплогрупп. Первая буква обозначает основную группу, другие буквы и цифры используются для наиболее ранних изменений в ДНК. Например, ваша отцовская гаплогруппа Е. Гаплогруппы E исторически встречаются в Африке. Есть два главных подразделения E-гаплогруппы – E1 и E2. Они, в свою очередь, имеют свои классификации. Например, если вы являетесь частью гаплогруппы E1b1a1, ваш предок, вероятно, происходил из южной части Африки. Но если вы являетесь частью E1b1b1b1a, то ваши предки, скорее всего, были берберами, которые жили на северо-западе Африки.

Гаплогруппа и гаплотип по материнской линии строятся по похожей системе, что может сбить с толку. Очень важно отметить, что материнские и отцовские группы совершенно разные. Гаплогруппа YDNA J1 и гаплогруппа мтДНК J1 не имеют совпадений!

Одно из преимуществ идентификации вашей гаплогруппы в том, что она может дать представление о происхождении ваших предков. Возможно, вы уже знаете, где они жили 200 или даже 300 лет назад, но некоторые гаплогруппы уходят в прошлое на 10 000 и более лет!

Если вы принадлежите к гораздо более новой гаплогруппе, например, появившейся всего одна-две тысячи лет назад, это может сузить поле поиска носителей похожих с вами генов еще больше.

Также имейте в виду, что на ДНК повлияли миграции народов, ведь люди в поисках лучших условий для жизни постоянно перемещались из региона в регион и вступали в браки. Это означает, что любая конкретная страна или регион будут иметь наиболее распространенные материнские и отцовские гаплогруппы. Однако к ним часто привязываются и некоторые другие, более редкие для этого региона, гаплогруппы.

Как определить гаплогруппу по гаплотипу? Для определения группы по типу необходимо знать модальные значения для большого числа локусов, поэтому специалисты используют специальное программное обеспечение, предикторы. Для более глубокого поискать необходимо использовать базы данных с маркерами, которые помогают отличить одну группу от другой.

Когда и где возникли гаплогруппы?

ДНК-исследования позволили выделить гаплотипы, понять, где они образовались и как мигрировали по планете. Это список Y-ДНК гаплогрупп всех типов:

Источник

СОДЕРЖАНИЕ

Формирование гаплогруппы

Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа

Другие хромосомы, аутосомы и Х-хромосомы у женщин разделяют свой генетический материал (так называемый кроссинговер, ведущий к рекомбинации) во время мейоза (особый тип деления клеток, который происходит в целях полового размножения ). Фактически это означает, что генетический материал этих хромосом смешивается в каждом поколении, и поэтому любые новые мутации случайным образом передаются от родителей к потомству.

Особенность, которую проявляют как Y-хромосома, так и мтДНК, заключается в том, что мутации могут накапливаться вдоль определенного сегмента обеих молекул, и эти мутации остаются фиксированными на месте в ДНК. Кроме того, можно сделать вывод об исторической последовательности этих мутаций. Например, если набор из десяти Y-хромосом (полученных от десяти разных мужчин) содержит мутацию A, но только пять из этих хромосом содержат вторую мутацию B, то это должен быть случай, когда мутация B произошла после мутации A.

Более того, все десять мужчин, несущих хромосому с мутацией A, являются прямыми потомками по мужской линии того же человека, который был первым человеком, несущим эту мутацию. Первый человек, несущий мутацию B, также был прямым потомком этого человека по мужской линии, но также является прямым предком по мужской линии всех мужчин, несущих мутацию B. Серии мутаций, такие как эта, образуют молекулярные линии. Кроме того, каждая мутация определяет набор определенных Y-хромосом, называемых гаплогруппой.

Все мужчины, несущие мутацию A, образуют единую гаплогруппу, и все мужчины, несущие мутацию B, являются частью этой гаплогруппы, но мутация B также определяет более позднюю гаплогруппу (которая является подгруппой или субкладом ), к которой мужчины, несущие только мутацию A, относятся. не принадлежит. И мтДНК, и Y-хромосомы сгруппированы в клоны и гаплогруппы; они часто представлены в виде древовидных диаграмм.

Гаплогруппа популяционная генетика

Это приводит к тому, что распространенность определенного маркера в популяции продолжает колебаться, пока она не достигнет 100% или полностью не выпадет из популяции. В большой популяции с эффективным смешиванием скорость генетического дрейфа общих аллелей очень мала; однако в очень небольшой популяции скрещивания пропорции могут измениться намного быстрее. Значительные географические вариации и концентрации определенных гаплотипов и групп гаплотипов, следовательно, свидетельствуют об отличительных эффектах повторяющихся узких мест в популяции или событий-основателей, за которыми следует разделение и увеличение популяции.

Линии, которые можно проследить из настоящего, не будут отражать полную генетическую изменчивость более старой популяции: генетический дрейф означает, что некоторые из вариантов вымерли. Стоимость полных тестов Y-ДНК и мтДНК ограничивала доступность данных; однако их стоимость за последнее десятилетие резко упала. Время слияния гаплотипов и текущая географическая распространенность несут значительную погрешность. Это особенно неприятно для времен слияния, потому что большинство популяционных генетиков все еще продолжают (хотя и немного сокращаются) использовать «метод Животовского», который подвергается резкой критике со стороны специалистов по ДНК-генеалогии за его ложность. Эусоциальная оса Angiopolybia pallens представлена ​​8 гаплогруппами в зависимости от ее местонахождения. Это отображает идею генетического дрейфа.

Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы человека

Основные гаплогруппы Y-хромосомы и их географические регионы распространения (до недавней европейской колонизации) включают:

Группы без мутации M168

Группы с мутацией M168

(произошла мутация M168

Группы с мутацией M89

(произошла мутация M89

Группы с мутациями L15 и L16

Группы с мутацией M9

(произошла мутация M9

Группы с мутацией M526

Гаплогруппы митохондриальной ДНК человека

Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа

Определение популяций

Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа

Гаплогруппы могут использоваться для определения генетических популяций и часто географически ориентированы. Например, следующие общие подразделения для гаплогрупп мтДНК:

Митохондриальные гаплогруппы делятся на три основные группы, которые обозначаются последовательными буквами L, M, N. Человечество сначала разделилось в группе L между L0 и L1-6. L1-6 дала начало другим L группам, одна из которых, L3, разделилась на группы M и N.

Группа M представляет собой первую волну миграции людей, которая, как считается, возникла за пределами Африки, следуя маршрутом на восток вдоль южных прибрежных районов. Потомки гаплогруппы M теперь встречаются по всей Азии, Америке и Меланезии, а также в некоторых частях Африканского Рога и Северной Африки; в Европе почти ничего не найдено. Гаплогруппа N может представлять еще один макролинейный возраст, который развился за пределами Африки, направляясь на север, а не на восток. Вскоре после миграции большая группа R отделилась от N.

Гаплогруппа R состоит из двух подгрупп, определенных на основе их географического распределения: одна находится в Юго-Восточной Азии и Океании, а другая включает почти все современные европейские народы. Гаплогруппа N (xR), то есть мтДНК, которая принадлежит к группе N, но не к ее подгруппе R, типична для популяций австралийских аборигенов, а также присутствует с низкой частотой среди многих популяций Евразии и Америки.

К типу L относятся почти все африканцы.

Принадлежность Y-хромосомы и географической гаплогруппы мтДНК

Вот список географических гаплогрупп Y-хромосомы и мтДНК, предложенный Bekada et al. 2013.

Y-хромосома

Источник

Гаплогруппы

Гаплогруппа (в популяционной генетике человека — науке, изучающей генетическую историю человечества) — группа схожих гаплотипов, имеющих общего предка, у которого в обоих гаплотипах имела место одна и та же мутация — однонуклеотидный полиморфизм. Термин «гаплогруппа» широко применяется в генетической генеалогии, где изучаются гаплогруппы Y-хромосомные (Y-ДНК), митохондриальные (мтДНК) и ГКГ-гаплогруппы. Генетические маркеры Y-ДНК передаются с Y-хромосомой исключительно по отцовской линии (то есть от отца сыновьям), а маркеры мтДНК — по материнской линии (от матери всем детям). Таким образом, мужчины являются носителями маркеров Y-ДНК.

Содержание

Популяционная генетика гаплогрупп

Предположительно, естественный отбор не действует или действует очень слабо в отношении мутации, приведшей к образованию гаплогруппы и находимой в наши дни. Тогда кроме скорости мутаций, варьирующейся от маркера к маркеру, основная причина изменения соотношения гаплотипов в популяции — это генетический дрейф, случайные флуктуации, вызванные количеством потомков соответствующего пола, которым был передан данный маркер. Это приводит к постепенному изменению пропорции данного маркера либо до 100 %, либо к его полному исчезновению из популяции. В большой популяции генетический дрейф распространённых аллелей очень мал, но в малой популяции, где скрещивание проходит между близкородственными особями, пропорция аллелей изменяется относительно быстро. Таким образом, наблюдаемая географическая разница в гаплогруппах вызвана эффектом бутылочного горлышка и/или эффектом основателя, за которыми последовали разделение популяции на отдельные группы или значительное увеличение числа особей. В более недавних популяциях обнаруживаются не все аллели, которые были в предыдущей популяции: генетический дрейф приводит к исчезновению некоторых аллелей из популяции. Стоимость определения гаплотипа ограничивает количество используемых образцов, поэтому достоверность выводов ограничивается возможной статистической ошибкой.

Классификация

Существует чёткая номенклатура классификации гаплогрупп в научном мире.

Гаплогруппы Y-ДНК

Дерево гаплогрупп Y-ДНК выглядит следующим образом:

Y-хромосомный Адам|ABT|BCT|DECF||DECF|GIJKH|IJK||IJLK(xLT)T|||I1I2J1J2MNOPS|NOP||NOQR|R1R2|R1aR1b

В 2002 году сообщество генетиков (Y Chromosome Consortium) выработало общую классификацию и номенклатуру по линиям Y-хромосомы. Выделено 18 основных мутационных кластеров в хромосоме, так называемые клады, обозначаемые латинскими буквами от A до R. Порядок букв отражает последовательность возникновения мутаций. Эти клады в свою очередь разветвляются на гаплогруппы, которые нумеруются цифрами и буквами.

До 2002 года применялись более простые обозначения по номерам гаплогрупп: НG1, HG2 и т. д. Таблица позволяет перевести старые обозначения, используемые в научных статьях, в современную номенклатуру.

УстаревшиеHG1HG2HG3HG8HG9HG12HG16HG21
YCCR1bIR1aE3aJKN3E3b

Гаплогруппы мтДНК

Дерево гаплогрупп мтДНК человека

Митохондриальная Ева|L0L1L2L3L4L5L6L7|MN||CZDEGQRASXYN1N2||||CZBFR0pre-JTPUKIN1aW|||HVJTUK||HVJTУстаревшие кластеры IWX

Ссылки

См. также

Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа

Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть фото Что такое гаплотип и гаплогруппа. Смотреть картинку Что такое гаплотип и гаплогруппа. Картинка про Что такое гаплотип и гаплогруппа. Фото Что такое гаплотип и гаплогруппа Генетика
Введение • История • Связанные темы • Список организаций • Список генетических терминов
Ключевые компонентыХромосома • ДНК • Нуклеотид • РНК • Геном
Поля генетикиКлассическая генетика · Консервационная генетика · Экологическая генетика · Иммуногенетика · Молекулярная генетика · Популяционная генетика · Квантитативная генетика
АрхеогенетикаСеверной и Южной Америки · Британских островов · Европы · Италии · Ближнего Востока · Южной Азии
Связанные темыГенетик · Геномика · Генетический код • Медицинская генетика · Молекулярная эволюция · Обратная генетика • Генетическая инженерия • Генетическое разнообразие • Наследственность • Генетический мониторинг

Полезное

Смотреть что такое «Гаплогруппы» в других словарях:

Y-хромосомные гаплогруппы в этнических группах — Перечисленные здесь для этнических групп гаплогруппы Y хромосомы основываются на соответствующих исследованиях. Данные для каждой гаплогруппы содержатся в двух столбцах количество проанализированных людей («n») и процент от общего числа.… … Википедия

Гаплогруппа E1b1b1 (Y-ДНК) — Гаплогруппа E1b1b1 Тип Y ДНК Время появления 11,000 22,400 лет назад[1] Место появления Восточная Африка (возможно, Северная Эфиопия) Предковая группа Гаплогруппа E1b1b Субклады Гаплогруппа E1b1b1*, Гаплогруппа E1b1b1a, Гаплогруппа E1b1b1b,… … Википедия

Генофонд славян — Распределение гаплогруппы R1a в Европе. Славянские популяции имеют относительно высокий процент R1a Генофонд славян (или генотип славян) термин, используемый для обозначения генетических особенностей славянского этноса по сравнению с… … Википедия

Гаплогруппа E1b1b1a1b (Y-ДНК) — Гаплогруппа E1b1b1a1b Тип Y ДНК Время появления VI тыс. до н.э.[1] Место появления Балканы или Западная Азия Предковая группа Гаплогруппа E1b1b1a1 Субклады Гаплогруппа E1b1b1a1b*, Гаплогруппа E1b1b1a1b1, Гаплогруппа E1b1b1a1b2, Гаплогруппа… … Википедия

Гаплогруппа E1b1b1a2 (Y-ДНК) — Гаплогруппа E1b1b1a2 Тип Y ДНК Предполагаемая дата появления 2115 1335 г.г. до н.э.[1][2] Предполагаемое место появления Балканы или Западная Азия … Википедия

Гаплогруппа H1 (мтДНК) — Гаплогруппа H1 Тип мтДНК Время появления 8,4 14,8 тыс. лет назад[1] Место появления Иберия или южная Франция Предковая группа H Субклады H1a, H1b, H1f, H1g, H1k, H1q, H1c, H1e, H1h, H1i, H1j, H1m, H1n, H1o, H1p, H1r, H1s, H1t, H1u, H1v, H1w, H1x… … Википедия

Гаплогруппа E (Y-ДНК) — Не следует путать с Гаплогруппа E (мтДНК). Гаплогруппа E Тип Y ДНК Время появления 50,000 до н.э.[1] Место появления Восточная Африка[2] или Азия[3] Предк … Википедия

Гаплогруппа L (Y-ДНК) — Не следует путать с Гаплогруппа L (мтДНК). Гаплогруппа L Тип Y ДНК Время появления 30 25 тыс. лет назад Место появления Индостан Предковая группа K Сестринские группы K(xLT) и T Субклады L1, L2 и L3 Мутации маркеры M20 Преобладающие носители… … Википедия

Гаплогруппа I2 (Y-ДНК) — Гаплогруппа I2 Тип Y ДНК Время появления 15 000 до н.э. Место появления юго восточная Европа Предковая группа I Сестринские группы I1 Субклады I2a, I2b Мутации маркеры M438/P215/S31 Преобладающие носители I2a2: боснийцы, хорваты; I2a1:… … Википедия

Гаплогруппа E1b1b1a1 (Y-ДНК) — Гаплогруппа E1b1b1a1 Тип Y ДНК Время появления 9500 6500 гг. до н.э.[1] Место появления Западный Египет (на востоке Ливийской пустыни) Предковая группа Гаплогруппа E1b1b1a Субклады Гаплогруппа E1b1b1a1*, Гаплогруппа E1b1b1a1a, Гаплогруппа… … Википедия

Источник

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *